| 市町村 | 樹種 | 名称 | 天然記念物指定 |
|---|---|---|---|
| 山形市 | イチョウ | 専称寺のおおイチョウ（山形市） | 市町村指定 |
| ゴヨウマツ | 蔵王連峰随一の「天竜の松」（蔵王） | ||
| スギ | 津金沢のスギ（山形市） | 県指定 | |
| スギ | 高沢の開山スギ（山形市） | 県指定 | |
| カツラ | 松尾山のカツラ（山形市） | 市町村指定 | |
| サイカチ | 霞城公園のサイカチ（山形市） | ||
| エドヒガン | 霞城のサクラ（山形市） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 六椹八幡宮のケヤキ（山形市） | ||
| ヒイラギ | 平清水のひいらぎ（山形市） | 県指定 | |
| 天童市 | アカマツ | 田麦野のかさまつ（天童市） | 市町村指定 |
| スギ | 臥龍山西常得寺の蟠形杉（天童市） | 市町村指定 | |
| ヒバ（アスナロ） | 道満の三光ヒバ（天童市） | 市町村指定 | |
| イヌザクラ | 小原のイヌザクラ（天童市） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 薬師神社ケヤキ林（天童市） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 大清水の大ケヤキ（天童市） | 市町村指定 | |
| ハルニレ | 元諏訪神社のハルニレ群（天童市） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 熊野神社の大ケヤキ（天童市） | 市町村指定 | |
| 山辺町 | スギ | 杉下大杉（山辺町） | 市町村指定 |
| 中山町 | イチョウ | 楯の大銀杏（中山町） | |
| アカマツ | 最上川伝承遺跡鍋掛松（中山町） | ||
| エドヒガン | お達磨の桜（中山町） | 県指定 | |
| 寒河江市 | カツラ | 桂の古木（寒河江市） | 市町村指定 |
| 河北町 | ゴヨウマツ | 蟠龍のマツ（河北町） | 県指定 |
| ケヤキ | 溝延の大ケヤキ（河北町） | 県指定 | |
| ケヤキ | 熊野神社の大欅（河北町） | 市町村指定 | |
| 西川町 | カツラ | 西川町吉川の千本カツラ | |
| ヤマグリ | 大井沢の大栗（西川町） | 県指定 | |
| 朝日町 | スギ | 豊龍神社の大スギ（朝日町） | 県指定 |
| 大江町 | スギ | 松保の大スギ（大江町） | 県指定 |
| スギ | 矢引沢大スギ（大江町） | 市町村指定 | |
| カヤ | 神代カヤ(大江町） | 県指定 | |
| ケヤキ | 柳川の大欅（大江町） | ||
| 村山市 | アカマツ | 臥龍のマツ(村山市） | 県指定 |
| アカマツ | 本覚寺の左右マツ（村山市） | 県指定 | |
| アカマツ | 尾上の松（村山市） | 市町村指定 | |
| スギ | 頼義の杉（村山市） | 市町村指定 | |
| スギ | 三吉山の三吉スギ（村山市） | 市町村指定 | |
| スギ | おくまん様の大スギ(村山市） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 愛宕神社のケヤキ林（村山市） | 県指定 | |
| 東根市 | カツラ | 大滝のカツラ（東根市） | 県指定 |
| ケヤキ | 東根の大ケヤキ(東根市） | 国指定 | |
| 尾花沢市 | スギ | 延沢城址の大スギ(尾花沢） | 県指定 |
| コウヤマキ | 龍護寺高野槇（尾花沢市） | 市町村指定 | |
| オオバボダイジュ | 尾花沢市楚町のマダの木 | なし | |
| 大石田町 | イチョウ | 向川寺の大イチョウ（大石田町） | 県指定 |
| カツラ | 向川寺の大カツラ（大石田町） | 県指定 | |
| コナラ | ワラ口のコナラ（大石田町） | 市町村指定 | |
| 新庄市 | スギ | 石動神社の親スギ（新庄市） | 県指定 |
| スギ | 角沢八幡神社のスギ（新庄市） | 市町村指定 | |
| カヤ | 市立図書館のカヤノキ（新庄市） | 市町村指定 | |
| ブナ | 山の神神社のブナ林（新庄市） | 市町村指定 | |
| イタヤカエデ | 角沢のイタヤカエデ（新庄市） | ||
| 金山町 | スギ | 大美輪の大杉（金山町） | |
| 最上町 | アカマツ | 東法田の大アカマツ(最上町） | 県指定 |
| トチノキ | 富沢のトチノキ(最上町） | 県指定 | |
| 舟形町 | アカマツ | 念仏のマツ（舟形町） | 市町村指定 |
| スギ | 猿羽根楯跡の親杉（舟形町） | 県指定 | |
| ハリギリ | 柴山夫婦センノキ（舟形町） | ||
| 真室川町 | スギ | 滝ノ沢の一本杉（真室川町） | 県指定／森の巨人１００選 |
| スギ | 熊野神社の大スギ（真室川町） | ||
| 大蔵村 | スギ | 岩神大権現スギ（大蔵村） | |
| クロベ | 岩神権現のクロベ（大蔵村） | 市町村指定／森の巨人１００選 | |
| ミズコナラ | 白須賀のミズコナラ（大蔵村） | 市町村指定 | |
| 鮭川村 | スギ | 曲川の大杉（鮭川村） | 市町村指定 |
| ブナ | 泉川八幡神社のブナ（鮭川村） | 市町村指定 | |
| ハリギリ | 鶴田野のハリギリ（鮭川村） | 市町村指定 | |
| 戸沢村 | スギ | 角川の大スギ(戸沢村） | 県指定 |
| スギ | 山ﾉ内黒すぎ（戸沢村） | ||
| スギ | 土湯杉の群生地（戸沢村） | ||
| ヤナギ | 津谷の大柳（戸沢村） | 市町村指定 | |
| 米沢市 | トラノオモミ（ハリモミ） | 西明寺のトラノオモミ（米沢市） | 県指定 |
| エゾエノキ | 長町裏のエゾエノキ(米沢市） | 県指定 | |
| エゾエノキ | 長町裏のエゾエノキ（米沢市） | 県指定 | |
| ヤマクワ | 山上の大クワ（米沢市） | 県指定 | |
| 南陽市 | イチョウ | 熊野神社の大イチョウ（南陽市） | 県指定 |
| アカマツ | 妹背の松（南陽市） | 県指定 | |
| スギ | 餅杉（南陽市） | 市町村指定 | |
| スギ | 二本杉（南陽市） | 市町村指定 | |
| 高畠町 | アカマツ | 千年松（高畠町） | 市町村指定 |
| アベマキ | 日向のアベマキ(高畠町） | 県指定 | |
| アベマキ | 竹森のアベマキ（高畠町） | 県指定 | |
| 川西町 | サイカチ | 洲島のサイカチ（川西町） | 市町村指定 |
| 長井市 | イチョウ | 遍照寺の大イチョウ（長井市） | 市町村指定 |
| アカマツ | 芦沢の千年マツ（長井市） | 市町村指定 | |
| スギ | 蘊安（ウンナン）神社のスギ（長井市） | 市町村指定 | |
| スギ | 岩切不動の門スギ（長井市） | 市町村指定 | |
| スギ | 葉山神社のスギ（長井市） | 市町村指定 | |
| エドヒガン | 伊佐沢の久保サクラ（長井市） | 国指定 | |
| ケヤキ | 白山神社の大ケヤキ（長井市） | 市町村指定 | |
| 小国町 | イチョウ | 飛泉寺のイチョウ（小国町） | 市町村指定 |
| スギ | 六斗沢のスギ（小国町） | 市町村指定 | |
| ヤチダモ | 飯豊山のヤチダモ（小国町） | 森の巨人百選 | |
| 白鷹町 | アカマツ | 細野かぶと松（白鷹町） | 市町村指定 |
| アカマツ | 伯楽の松（白鷹町） | ||
| スギ | 羽黒神社の大杉（白鷹町） | 市町村指定 | |
| スギ | 諏訪神社の千年杉（白鷹町） | 市町村指定 | |
| エドヒガン | 薬師ザクラ（白鷹町） | 県指定 | |
| エドヒガン | 釜の越ザクラ（白鷹町） | 県指定 | |
| 鶴岡市 | イチョウ | 湯田川の乳イチョウ（鶴岡市） | 県指定 |
| イチョウ | 砂川の乳銀杏（鶴岡市） | 市町村指定 | |
| イチョウ | 早田の御葉付イチョウ（鶴岡市） | 国指定 | |
| モミ | 白滝不動尊のモミ（鶴岡市） | 市町村指定 | |
| クロマツ | 村上屋の念珠マツ（温海町） | 県指定 | |
| スギ | 羽黒山のスギ並木（羽黒町） | 国指定 | |
| スギ | 熊野神社の大スギ（鶴岡市） | 国指定 | |
| スギ | 山五十川の玉スギ（温海町） | 国指定 | |
| スギ | 添川の根子スギ（藤島町） | 県指定 | |
| クロベ | 十文字開発記念樹（藤島町） | 県指定 | |
| スギ | 皇壇スギ（鶴岡市：旧朝日村） | 県指定 | |
| スギ | 羽黒山の爺杉（鶴岡市） | 国指定 | |
| スギ | 勝地の大杉（鶴岡市） | 市町村指定 | |
| タブ | 馬場町のタブの木(鶴岡市） | 県指定 | |
| ケヤキ | 文下のケヤキ（鶴岡市） | 国指定 | |
| ケヤキ | 六所神社ケヤキ（鶴岡市） | 市町村指定 | |
| シナノキ | 池の平のシナノキ | 市町村指定 | |
| ヒサカキ | 曹源寺のヒサカキ（鶴岡市） | 県指定 | |
| 庄内町 | イチョウ | 三ヶ沢の乳イチョウ(立川町） | 県指定 |
| クロマツ | 払田の地蔵の松（庄内町） | 県指定 | |
| クロマツ | 舟つなぎの松（庄内町） | 市町村指定 | |
| エゾエノキ | ナンジャモンジャの木（庄内町） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 廻楯の大欅（庄内町） | 市町村指定 | |
| 社叢 | 熊野神社の森（立川町） | 市町村指定 | |
| 三川町 | ハルニレ | 青山神社のハルニレ（三川町） | 市町村指定 |
| ケヤキ | 山の神のケヤキ（三川町） | 市町村指定 | |
| 酒田市 | スギ | 総光寺参道のキノコスギ(松山町） | 県指定 |
| スギ | 小林不動杉（平田町） | 市町村指定 | |
| ケヤキ | 山楯の大欅（平田町） | 県指定 | |
| ユズ | 土淵のユズ(松山町） | 県指定 | |
| 遊佐町 | ハリモミ | 永泉寺のハリモミ（遊佐町） | 県指定 |
| スギ | 小野曽の千本杉（遊佐町） | 市町村指定 | |
| タブ | 吹浦三崎山のタブ林（遊佐町） | 県指定 | |
| ムクノキ | 岡田のムクノキ（遊佐町） | 県指定 |
